Гигантская пространственно-временная аномалия под названием «Каскад Хаоса» внезапно начинает сильно искажать Таймлайн. Из-за этого в одной Вселенной вынуждены сосуществовать множественные «разветвления» временных линий.
Так, кроме Доктора, идущего по известному нам из событий канона пути, постепенно появляются другие его версии: например, избежавший регенерации Десятый Доктор, спасший Ривер Сонг Одиннадцатый Доктор и выживший после событий на Мондасианском корабле Двенадцатый Доктор.
Нескольким регенерациям Доктора, их спутникам и союзникам придется столкнуться с опасными последствиями возникающих временных парадоксов, найти их источник и попытаться предотвратить гибель Вселенной. При этом, желательно, не уничтожив в процессе собственные «параллельные» линии жизни.

Игры Таймлордов с судьбами мира не прошли бесследно. Таймлайн истончается от агрессивных попыток вмешаться в прошлое или изменить будущее. И, в конце концов, сама Матрица (которую Таймлорды ошибочно считают изобретенной ими информационной сетью, а не вступившей с ними в контакт разумной силой) начинает им противится. Она намерена воспользоваться каким-нибудь крупным кризисом, чтобы "перезапустить" Вселенную и продолжить экспериментировать уже с новыми цивилизациями.

Подходящий момент наступает, когда (по пока не известной причине) активизируется так называемый «Каскад Хаоса» — гигантская серия разрывов в ткани пространства-времени на краю Вселенной. Эта космическая аномалия получила имя в честь явления, иначе известного как «каскад бифуркаций» и описывающего ситуацию, при которой одно небольшое событие запускает цепную реакцию, приводящую к постепенному переходу системы из состояния Порядка в состояние Хаоса.
Так и происходит. Каскад Хаоса начинает влиять на Таймлайн и постепенно искажает его, отчего в одной Вселенной вынуждены сосуществовать множественные «разветвления» временных линий.

Сильнее всего Хаос влияет на тех, кто часто взаимодейсвует с различными парадоксами — а именно, на беглых Таймлордов, их спутников и прочих путешественников во времени. Желание некоторых из них изменить что-то в своей судьбе заставляет их линию жизни "раздвоиться". Так, кроме Доктора, идущего по известному нам из событий канона пути, постепенно появляются другие его версии: избежавший регенерации Десятый Доктор, спасший Ривер Сонг после их свадьбы Одиннадцатый Доктор и выживший после событий на Мондасианском корабле Двенадцатый Доктор.
Со временем Хаос неминуемо начнет влиять на все большее количество существ и событий. Ошибки и несостыковки в таймлайне будут накапливаться, что в перспективе грозит полным «схлопыванием» пространства-времени - то есть гибелью Вселенной, когда количество вызванных парадоксов превысит критическую отметку.

- A Thousand Cuts (The Master, Tenth Doctor, Missy) - Альтернативный финал Десятого сезона. Избежавший регенерации Десятый Доктор и выживший Мастер_Симм объединяют усилия и на новой ТАРДИС Мастера отправляются на Мондассианский корабль, чтобы вмешаться в конфликт между Мастером и Мисси.
- Metamorphosis (Lolita, Idris) - Оставленная Десятым Доктором в Древней Греции ТАРДИС (Идрис) встречает свою "сестру" Лолиту - первую ТАРДИС Мастера, которая обладает антропоморфной формой и огромным желанием найти своего пилота, а еще показать Идрис все плюсы существования в теле.

- Одиннадцатый Доктор пытается убежать от судьбы и вместе с Ривер Сонг скрывается в «карманной вселенной» (Эпизод: Тени прошлого). Он не подозревает, что на самом деле их убежище возникло под влиянием сил Хаоса и скоро им предстоит столкнуться с серьезными последствиями. Кроме того, Одиннадцатый Доктор не может забыть и о своей первой спутнице — Амелии Джессике Понд, словно предчувствуя грозящую ей опасность.

- Fool me Once, Fool Me Twice (Twelfth Doctor, Missy, The Master) - Совсем не по плану начинают идти события на мирном этаже Мондассианского корабля, где Двенадцатый Доктор, Мисси и Мастер пытались спастись от киберменов.
- All I Ever Wanted (Twelfth Doctor, Missy) - В итоге, Мисси удается вернуться к Двенадцатому Доктору в самый разгар последней битвы и сразиться с киберлюдьми вместе с ним.

I know you'd never lie - Юность Доктора. Тета Сигма впервые увозит Кощея на Землю.

Gravitational Wave Merger - Юность Мастера. Кощей знакомится с той, что познакомит его со звездами.

Parade of Planets - Юность Доктора и Мастера. Тета Сигма и Кощей пытаются сбежать с уроков ради чего-то более веселого.

Blindfold - За некоторое время до года, которого не было. Потеряв Девятого Доктора, Джек пока еще не нашел Десятого. А тем временем, Мастер уже вернулся на Землю и активно занимается подготовкой к захвату планеты.

Once again I'm drawn toward oblivion - Начало совместных приключений Одиннадцатого Доктора и Эми. После спасения звездного кита Доктор в компании Эми снова оказывается в Кастровальве - довольно странном месте, где давным-давно он кое-кого оставил.

Two Hearts in Pieces - Когда Двенадцатый Доктор потерял Клару. Снова оставшись один, Доктор отправляется в прошлое, чтобы увидеть Эми и под личиной незнакомца узнать все о ее не слишком счастливой жизни.

Control in, Control out [Doctor Who] - Где-то между The Empress of Mars и World Enough and Time. Желая подготовить Мисси к путешествиям вместе со своими спутниками, Доктор впервые берет свою пленницу вместе с собой на тренировочную миссию.

Everybody Wants To Be My Enemy [Doctor Who] - После того как Одиннадцатый Доктор потерял своих спутников. Доктор находится в депрессии. Мисси не очень хочет вмешиваться в его таймлайн, но очень хочет как-нибудь его развеселить. Правда, ее понятие о веселье столь же своеобразно, сколь и о хороших подарках на день рождения. (Halloween Special, отыгрыш приостановлен до осени 2026)

Нам остаются круги на воде - Альтернативный финал Десятого сезона. АУ по отношению к событиям сюжета основной игры. Предотвратив фатальное столкновение между Мастером и Мисси, Десятый Доктор принудительно забирает обоих с Мондассианского корабля и помещает в симуляцию безопасной жизни под маской человеческих личностей в надежде, что это поможет им примириться.

A Scandal in Beltharia [Doctor Who] - После окончания Восьмого Сезона. Детективный сюжет в духе Шерлока Холмса. Двенадцатому Доктору предстоит раскрыть тайну похищения египетских древностей в Викторианском Лондоне, предотвратить межпланетный конфликт и сильно вдохновить начинающего писателя. Но только избежать Мисси ему не удастся.

The Feminine Urge to Disappear - После исчезновения Беллы из Плезантвью. У Беллы Гот есть обычное женское стремление спланировать собственное исчезновение и обвинить в нем мужчину, у Мисси — необходимость остановить мелкую расу инопланетян-падальщиков, паразитирующих на чужих ресурсах. Эти два абсолютно разных сюжета внезапно пересекаются на маленьком корабле на задворках известного космоса.